Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms