Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
C10orf55Q5SWW7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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