Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms