Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA8Q53HL2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA8Q53HL2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms