Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms