Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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