Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A52Q3SY17 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms