Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms