Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms