Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms