Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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