Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RTN1Q16799 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RTN1Q16799 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RTN1Q16799 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RTN1Q16799 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTN1Q16799 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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