Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms