Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA6Q15825 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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