Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNHIT3Q15649 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms