Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLD3Q15054 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms