Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms