Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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