Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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