Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTAN1Q13813 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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