Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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