Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LAMB3Q13751 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMB3Q13751 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms