Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTCH1Q13635 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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