Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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