Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FOXE3Q13461 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FOXE3Q13461 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FOXE3Q13461 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FOXE3Q13461 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FOXE3Q13461 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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