Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME3Q13232 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME3Q13232 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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