Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RLFQ13129 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RLFQ13129 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RLFQ13129 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RLFQ13129 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RLFQ13129 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RLFQ13129 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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