Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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