Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPTFQ12830 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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