Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TROQ12816 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TROQ12816 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TROQ12816 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TROQ12816 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TROQ12816 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TROQ12816 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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