Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAPQ12770 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms