Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms