Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP7AQ04656 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms