Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms