Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms