Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms