Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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UFM1P61960 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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