Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms