Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms