Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D1P54289 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms