Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIRAP54198 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIRAP54198 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIRAP54198 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms