Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms