Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB28P51157 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB28P51157 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB28P51157 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms