Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms