Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSEN1P49768 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms