Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A1P49279 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms