Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms