Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJC1P36383 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms