Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms