Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms